La Divisione Investigativa è strutturata in due sedi principali, a Milano e Treviso, presso le quali operano le unità investigative specializzate. Alle sedi principali fanno capo le unità locali situate in diverse regioni d'Italia, nonché le rappresentanze del Regno Unito e di Malta. Ciò consente all'Istituto di operare sull'intero territorio nazionale nonché nei paesi del Nord Europa e dell'area del Mediterraneo.
Analisi investigative
Scena del crimine
Incendi ed esplosioni
Ingegneria forense
Digital Forensics
Contraffazioni e frodi
Direzione Investigativa Milano
- Unità AISO Analisi Investigative e Supporto Operativo Squadra sopralluoghi e rilievi tecnici
- Unità DCF Digital & Computer Forensics
Direzione Investigativa Treviso
- Unità ISC Investigazione Scena del Crimine
- Unità INF Ingegneria Forense
- Unità IIE Investigazione Incendi ed Esplosioni
- Unità ICF Investigazione Contraffazioni e Frodi
Unità Operative Territoriali e Laboratori
- Milano
- Treviso
- Pordenone
- Bolzano
- Parma
- Novara
- Vicenza
- Catanzaro
- Catania
Rappresentanze in Europa
- Londra
- Malta